Filmoteka Szkolna to projekt adresowany do szkół, mający na celu upowszechnienie programu edukacyjnego Filmoteka Szkolna. Wszystkie polskie szkoły otrzymały na początku 2009 roku zestaw płyt DVD Filmoteka Szkolna zawierający 55 filmów ułożonych w 26 wątków tematycznych. Filmy odnoszą się do zagadnień zawartych w podstawie programowej kształcenia ogólnego. Mogą być wykorzystane na lekcjach wychowawczych, języka polskiego, historii, wiedzy o społeczeństwie, wiedzy o kulturze, a także na zajęciach pozalekcyjnych.
Filmoteka Szkolna to projekt Polskiego Instytutu Sztuki Filmowej i Centrum Edukacji Obywatelskiej wspierający gimnazjalistów i licealistów na drodze edukacji filmowej, kulturalnej i obywatelskiej, a nauczycieli w wykorzystaniu materiału filmowego.
Filmoteka Szkolna ma na celu promocję dobrych praktyk z zakresu edukacji filmowej, a także stwarzanie możliwości do ogólnopolskiej wymiany doświadczeń.